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Bioinformatik Programmier-Pakete

Open Bioinformatics Foundation: Bioperl, Biojava, Biopython

Open Bioinformatics Foundation

Bei dieser Organisation handelt es sich um einen Zusammenschluss Freiwilliger, welche die open-source Programmierung in der Bioinformatik fördern/vorantreiben wollen.  Einige Projekte sind zB BioJava, BioPerl und BioPython. Weitere Informationen und eine Liste der Projekte lassen sich dem entsprechenden Wikipedia-Eintrag entnehmen.

 

Zwei Beispiele:

BioJava

BioPerl

 

Bioclipse

 Auch ein nettes Tool ist Bioclipse, welches im Grunde genommen aus einem angepassten Eclipse besteht. Es weist nicht nur einen Seqeunz-Editor sondern zB auch Editoren für Moleküle auf. (Wikipedia-Eintrag)

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